Unione differenze Rational ClearCase consente di confrontare due o più file, directory o versioni, rappresentando graficamente le differenze tra essi.
Se utilizzato nel contesto di una unione (ad esempio, se viene richiamato indirettamente dal programma di gestione unioni o se viene utilizzato direttamente utilizzando il comando cleartool merge -graphical), Unione differenze consente di risolvere le differenze tra contributori in modalità grafica, unendo i risultati in un singolo file, directory o versione.
Se utilizzato al di fuori del contesto di unione (ad esempio, eseguendo un confronto in un browser struttura ad albero versioni o utilizzando il comando cleartool diff -graphical), si potranno visualizzare soltanto le differenze tra i file, directory o versioni; la funzione di unione non sarà disponibile.