A köztes szoftver ügynök egy kiszolgálófolyamat, amely a WebSphere Virtual Enterprise alkalmazást nem futtató kiszolgálók kezelésére szolgál. A köztes szoftver ügynököt bármely csomópontra telepítheti, amely másik köztes szoftver kiszolgálót futtat (mint például a PHP és az Apache Tomcat). Ezután létrehozhatja ezeknek a csomópontoknak és kiszolgálóknak az ábrázolását, és az adminisztrációs konzolon kezelheti azokat.