Agent warstwy pośredniej jest procesem serwera umożliwiającym zarządzanie serwerami, na których nie działa produkt WebSphere Virtual Enterprise. Agent warstwy pośredniej należy zainstalować w każdym węźle, w którym działają inne serwery warstwy pośredniej, takie jak PHP i Apache Tomcat. Następnie można utworzyć reprezentacje tych węzłów i serwerów oraz zarządzać nimi w Konsoli administracyjnej.